在专项审计中，注册会计师需关注高新技术产品或服务的识别尽管注册会计师不是高新技术领域的专家，但有明确职责界定和声明书的要求此外，专项审计指引强调识别和评估重大错报风险的重要性，特别是申报企业是否存在为了税收优惠而伪造数据的情况了解与申报明细表相关的内部控制制度是审计的重要环节。

高新技术企业年度审计需要提交以下材料企业章程近三年的利润表近一年的高新技术产品服务收入明细表近三年的研发费用结构明细表主要研究开发项目的基本情况说明营业执照及近三年的企业所得税纳税申报表其中，企业章程需详细说明企业的基本信息经营范围及管理制度等利润表则反映了企业的经营。

高新技术企业在进行专项审计时，主要分为两项内容近三年费用审计和近三年收入审计这些审计工作需要由具备审计资格的会计师事务所来执行各地通常会公布一份入围的会计师事务所名单，企业可以根据名单选择合适的事务所进行合作在进行审计时，企业需要准备近三年的凭证及报表，会计师事务所将依据这些资料。